云南省肿瘤研究所是按国家“院所合一”要求创办的处级研究机构
1983年，云南省政府批准成立了云南省肿瘤研究所，第一任所长由原昆明医学院老院长周克敏教授兼任，设在昆医附一院
1999年6月，在省卫生厅领导的主持下，将云南省肿瘤研究所划归云南省肿瘤医院管理，至今已有26年历史，2002年陈明清教授兼任所长，2004年汤学良教授兼任所长，2005年黄云超教授兼任所长，2025年张国君院长兼任所长
